Все мы хорошо знаем, что многие лекарственные препараты дают побочные эффекты, но они всегда описаны в инструкции по применению, а препараты обычно выписывает по рецепту доктор, которому мы доверяем. Главная героиня фильма «Побочный эффект» тоже доверилась своему врачу, но как оказалось зря. Эмили терзается и мучится от мыслей о предстоящей встрече с мужем. Он находится в тюрьме, но скоро подходит срок его освобождения. Три года, которые он провёл в тюрьме, быстро пролетели, и теперь Эмили никак не может смириться с мыслью о его возвращении домой. У девушки не просто расшатались нервы, а случился настоящий срыв. Она обращается за помощью к своему психоаналитику. Эмили некоторое время посещает его сеансы, но ничего не помогает. Доктор видит, что его пациентка нуждается в более сильном средстве, чем просто разговоры и обычное успокоительное средство. Доктору нравится Эмили, и он заинтересован в её скорейшем выздоровлении. Он предлагает Эмили попробовать пройти новый курс. Лекарственный препарат пока находится в экспериментальной стадии. Эмили соглашается на такое лечение, потому что не видит другого выхода. Однако таблетки, которые дал ей доктор дают сильные побочные эффекты. У девушки начинаются серьёзные проблемы с психикой, если бы она знала, к чему приведёт приём экспериментальных таблеток, то никогда бы не согласилась их принимать. События в фильме «Побочный эффект» примут неожиданный поворот. Эмили сама того не зная изменила свою жизнь, а вернуться назад будет очень сложно, практически невозможно.